MMR zahájilo práce s návrhem národních rozvojových priorit (schválených vládou v létě 2011), následně rozpracovaných do tematických okruhů vymezujících věcné zaměření budoucích cílů programů. V listopadu 2012 byly vládou schváleny programy pro 2014 – 2020, které se v tuto chvíli rozpracovávají pod gescí řídicích orgánů. Zástupci všech partnerů vč. zástupců měst a obcí apod. mohou své požadavky, podněty, připomínky uplatňovat v rámci jednotlivých platforem, kterých jsou členy (platforem všech programů vč. střechových skupin pro přípravu Dohody o partnerství).

Po celou dobu jsou při debatách ohledně podoby programového období 2014 – 2020 přítomni relevantní zástupci SMO (Svaz měst a obcí), SMS (Sdružení místních samospráv), SPOV (Spolek pro obnovu venkova) atd. MMR reflektuje jejich reakce a snaží se respektovat dostatečné zohlednění potřeb měst a obcí. Kromě toho se aktuálně vyjednává s městy a dalšími regionálními partnery nastavení míry jejich zastoupení v nastavování  regionálních a místních strategií pro čerpání evropských fondů. 

S výjimkou IROPu se však nebavíme o podílu ve výši desítek %, jak je nyní mediálně prezentováno. Pokud města a obce prokáží přínos investovaných prostředků nejen pro jejich vlastní rozvoj prostřednictvím smysluplných projektů a dosáhnou stanovených cílů, existuje prostor ve výši minimálně 7 % celkového objemu prostředků rozdělit v jejich prospěch jako výkonnostní rezervu.

MMR se zároveň soustředí na minimalizaci byrokratické zátěže. Došlo ke snížení (zesrozumitelnění) počtu programů, sjednocují se pravidla, elektronizuje se celý proces…